针对您提出的“公司申请了工伤认定之后，本人又在手机上申请了怎么办”的问题，首先我们要明确工伤认定的申请流程和规定。

在《工伤保险条例》中，对于工伤认定的申请有明确的规定。通常情况下，职工发生事故伤害或被诊断为职业病后，应由所在单位在规定时间内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果单位未按规定时间提出，工伤职工或其近亲属、工会组织在一年内也可以直接向社会保险行政部门提出工伤认定申请。

现在，针对您的情况，如果公司已经为您申请了工伤认定，而您个人又在手机上进行了申请，这实际上可能造成了重复申请的情况。在这种情况下，社会保险行政部门会根据实际情况进行处理，通常会以最先受理的申请为准，或者根据后续审核的情况，对两个申请进行合并处理。

重要的是，无论您还是公司哪一方提出了申请，社会保险行政部门都会根据提交的材料和事实情况进行工伤认定。因此，您不必过于担心重复申请会带来什么负面影响，只需确保提交的材料真实、完整，以便社会保险行政部门能够准确、及时地进行工伤认定。

另外，如果您对工伤认定的流程或结果有任何疑问，都可以向当地的社会保险行政部门咨询，或者依法申请行政复议、提起行政诉讼来维护自己的合法权益。

总之，对于工伤认定的申请，重要的是确保材料的真实性和完整性，以及按照规定的流程和时间节点进行申请。如果出现重复申请的情况，社会保险行政部门会根据实际情况进行处理，您只需配合提供必要的材料和信息即可。