单位不满二年亏本卖房仍需依法缴纳增值税。针对这一问题，具体分析如下：

一. 单位卖房增值税缴纳规定

1. 根据《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》(财税〔2016〕36号)附件3:《营业税改征增值税试点过渡政策的规定》中的明确规定，个人将购买不足2年的住房对外销售的，需要按照5%的征收率全额缴纳增值税。这一条款虽然直接针对的是个人，但同样适用于单位在不满二年内卖房的情况，因为增值税的缴纳并不因卖房是否亏本或盈利而有所区别。
2. 增值税的缴纳是基于商品（包括房产）的流通环节，与单位的盈亏状况无关。即使单位亏本卖房，只要房产的购买时间不满二年，就需要按照法规缴纳增值税。

二. 合法性分析

1. 依法纳税是单位和个人的义务。单位在卖房时，如果房产购买时间不满二年，就必须按照法规缴纳增值税，这是合法的，也是必须履行的义务。
2. 如果单位未按规定缴纳增值税，将可能面临税务部门的处罚，包括但不限于补缴税款、缴纳滞纳金、罚款等。

综上所述，单位不满二年亏本卖房仍需依法缴纳增值税，这是合法的，也是必须遵守的法规。如有进一步需要，您可以继续咨询我。