当您遇到已经通过法院调解偿还了借款，但借条未收回且又被对方起诉的情况时，您应当积极应对并采取相应的法律措施来保护自己的权益。以下是一些具体的建议：
一、收集还款证据
首先，您需要尽可能收集所有能证明您已经偿还了借款的证据。这些证据可以包括但不限于：
银行或电子支付平台的转账记录：这是最直接且有力的证据，可以清晰地显示您已经将款项转给了对方。
聊天记录：如果您和对方在还款前后有过相关的聊天记录，特别是提及还款事宜的，这些记录也可以作为辅助证据。
证人证言：如果有第三方见证了您的还款过程，他们可以提供证人证言来支持您的主张。
通话录音：如果您和对方在电话中讨论过还款事宜，并且您保存了通话录音，这也是一份有力的证据。
二、积极应诉
在收到法院的起诉状后，您应当按时参加诉讼，并按照法庭的要求提交您的答辩意见和证据。在庭审中，您需要向法院详细说明您已经偿还了借款，并出示您收集到的证据。如果证据充分，法院通常会驳回对方的诉讼请求。
三、注意法律程序
在整个过程中，您需要注意遵守法律程序，确保您的所有行为都符合法律的规定。例如，您需要确保您提交的证据是真实、合法且与案件相关的。如果您对法律程序不熟悉，可以考虑咨询专业的律师来帮助您应对。
四、维护自身权益
如果最终您胜诉了，但诉讼过程中给您带来了时间成本、精力消耗等问题，或者对您的名誉产生了影响，您可以考虑采取一些措施来维护自己的权益。例如，您可以要求对方承担部分或全部的诉讼费用，或者通过其他合法途径来恢复您的名誉。
总之，面对这种情况，您需要保持冷静，积极收集证据，并按照法律程序来应对。只要您的证据充分且合法，您就有很大的机会维护自己的权益。