对于事业单位工作人员违法的问题，处理措施需要严格遵循相关法律法规，并根据违法的性质、情节轻重及具体触犯的法规来综合判定。以下是对此类情况处理的详细解答：
一、总体处理原则
事业单位工作人员违法，无论其是否在职或已退休，都应依法进行处理。对于在职人员，若涉嫌违纪违法，将依据相关规定给予相应的纪律处分；对于退休人员，虽不再作出处分决定，但应立案调查并明确其应受处分的种类，同时调整其相关待遇。
二、具体处理措施
刑事犯罪的处理：
- 若事业单位工作人员被依法判处刑罚，如有期徒刑、拘役等，必须按照司法判决执行，并在服刑期间停发其基本养老金或工资。
- 服刑期满后，其养老金或工资待遇会重新核定，通常按服刑前标准扣除一定比例后发放。
违反党纪政纪的处理：
- 具有党员身份的工作人员，若违反党纪，将受到警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍等处分。
- 对于违反政纪的行为，监察机关或所在单位可根据违法情节给予警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等政纪处分。
一般违法行为的处理：
- 对于行政违法行为，如违反治安管理处罚法，相关行政机关将依法给予警告、罚款、行政拘留等处罚。
- 所在单位也可根据具体情况进行内部处理，如批评教育、通报批评等。
违规取酬的处理：
- 若事业单位工作人员存在违规取酬行为，应追回全部违规所得，并根据情节轻重给予纪律处分、行政处罚乃至刑事责任追究。
- 同时，应完善薪酬管理制度，加强预防和监管，防止类似问题再次发生。
三、后续监督与整改
- 跟踪监督：确保处理决定得到切实执行，包括退还违规所得、接受纪律处分等。
- 制度完善：针对违法违规事件暴露的制度漏洞和管理问题，应完善相关制度规定，从源头上防止类似问题再次发生。
- 加强预防与监管：建立健全监督和审计机制，加强对事业单位人员的监管和宣传教育，提高其法律意识和职业道德水平。
四、相关法律依据
- 《中华人民共和国公职人员政务处分法》等相关法律法规为处理事业单位工作人员违法行为提供了法律依据。
- 《事业单位工作人员处分暂行规定》也明确了对事业单位工作人员违法行为的处理方式和程序。
综上所述，事业单位工作人员违法后，将面临包括刑罚执行、纪律处分、行政处罚、内部处理以及经济处罚等一系列处理措施。这些处理均将严格依法进行，以确保公平公正。同时，也应加强预防和监管工作，从根本上避免类似问题的发生。