公司员工被指控组织卖淫，公司通常没有直接的赔偿义务。下面我将从几个角度详细分析这个问题：

1. 法律责任界定：

   • 组织卖淫是严重的刑事犯罪行为，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，涉嫌组织卖淫的个人或单位将承担相应的刑事责任。
   • 如果公司员工被指控组织卖淫，那么其个人将面临法律的制裁，而公司作为雇主，并不直接因其员工的个人犯罪行为而承担赔偿责任。

2. 公司责任与员工个人责任：

   • 公司的责任通常限于其作为法人实体的行为，如违法经营、侵犯员工权益等。员工个人的犯罪行为，除非公司参与其中或明知而纵容，否则公司不承担连带责任。
   • 在大多数情况下，员工个人的犯罪行为是其个人行为，与公司无关，因此公司没有赔偿的义务。

3. 特殊情况下的公司责任：

   • 如果公司有明确的规章制度禁止员工从事违法活动，并且对员工进行了充分的培训和教育，但员工仍然违反了规定并犯下了罪行，那么公司在此情况下通常不需要承担赔偿责任。
   • 然而，如果公司被证明对员工的犯罪行为有纵容、包庇或默许的行为，或者公司因管理不善导致员工有机会实施犯罪行为，那么公司可能会因此承担一定的民事或行政责任，但这并不等同于直接的赔偿责任。

4. 法律建议：

   • 对于公司而言，重要的是建立健全的规章制度，明确禁止员工从事任何违法活动，并加强对员工的培训和教育，以预防类似事件的发生。
   • 如果公司员工确实被指控组织卖淫，公司应积极配合司法机关的调查，提供必要的协助和证据，以维护自身的合法权益。

综上所述，公司员工被指控组织卖淫时，公司通常没有直接的赔偿义务。但公司应加强内部管理和员工教育，以预防类似事件的发生。如果你或你所在的公司面临类似问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。