针对您提出的“不起诉案件能否申请封存和消除”的问题，这需要根据具体的不起诉类型以及相关的法律规定来判断。以下是对此问题的详细解答：

一、不起诉的类型与案底的关系

1. 法定不起诉：若犯罪嫌疑人根本不构成犯罪或依法不应追究刑事责任，则从理论上讲，不存在案底一说。因为在这种情况下，犯罪嫌疑人并未被认定为有罪。

2. 酌定不起诉：虽然检察机关作出了不起诉决定，但犯罪事实已被认定。在这种情况下，案底依然存在。不过，对于符合特定条件的被不起诉人，其相关记录可能会受到封存等限制公开的措施。

3. 证据不足不起诉：这只是因为证据问题而未起诉，犯罪记录仍会留存。这种情况下，虽然未对被犯罪嫌疑人进行起诉，但由于犯罪事实的嫌疑并未完全消除，因此案底也会保留。

二、不起诉案件记录的封存与消除

关于不起诉案件记录的封存与消除，这并非一概而论。在某些地区，如名山区检察院，为了推进轻罪治理体系现代化，减轻轻罪犯罪附随后果，创新推行了不起诉案件记录封存制度。这一制度旨在保护被不起诉人的隐私权、受教育权、就业权等合法权益，利于其顺利回归社会。

具体来说，该制度包括：

• 明确不起诉案件记录封存的适用范围、启动程序、具体实施等各流程程序规范。
• 对被不起诉人出具无犯罪记录证明，切实保障其就业权。
• 对不起诉封存案件进行专门标识和独立保管，除依法依规查询外，不得向任何单位和个人提供。

然而，值得注意的是，这一制度并非在全国范围内普遍实施。是否能够对不起诉案件记录进行封存和消除，还需要根据当地的法律规定和实际情况来判断。

综上所述，不起诉案件能否申请封存和消除，需要根据具体的不起诉类型、当地的法律规定以及实际情况来综合判断。如果您有此类需求，建议咨询当地的法律专业人士或相关机构以获取更准确的解答和帮助。