检察院不起诉的案件，其相关记录的处理方式需根据不起诉的类型及具体情形来判断，但通常不会直接“封存”整个案件，而是根据法律规定和案件情况作出相应处理。以下是对此问题的详细分析：
一、不起诉的类型及记录处理
法定不起诉：
- 适用情形：根据《刑事诉讼法》第十六条，对于情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪，或犯罪已过追诉时效期限，或经特赦令免除刑罚等情形，检察院应作出不起诉决定。
- 记录处理：由于这些情形下犯罪嫌疑人的行为不被认定为犯罪或依法不需追究刑事责任，因此通常不会留下犯罪记录，即“案底”。相关记录可能仅在司法机关内部系统中留存，但不会对个人产生公开的不利影响。
酌定不起诉：
- 适用情形：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，检察院可作出不起诉决定。
- 记录处理：尽管行为构成犯罪，但因情节轻微等原因不需判处刑罚，检察院作出酌定不起诉后，通常也不会留下犯罪记录。然而，某些特定行业或职业可能根据内部规定进行一定处理或记录，但这与法律意义上的案底不同。
存疑不起诉：
- 适用情形：根据《刑事诉讼法》第一百七十五条，对二次补充侦查后仍认为证据不足的案件，检察院应作出不起诉决定。
- 记录处理：因证据不足而无法认定犯罪嫌疑人有罪，故不会留下犯罪记录。但相关证据材料和审查过程记录仍会保存在司法机关内部系统中，以备后续可能的复查或复议。
二、特殊情况下的记录处理
- 被害人申诉或自诉：若被害人不服检察院的不起诉决定，可以向上一级检察院申诉，或直接向法院提起自诉。在这种情况下，若案件重新进入审判环节，相关记录将作为案件材料被法院审查，并可能产生新的法律后果。
- 公安机关申请复议复核：公安机关认为检察院不起诉决定有错误时，可以要求复议，意见不被接受时还可向上一级检察院提请复核。此过程主要在检察院体系内进行，但若案件因此重新进入审判环节，相关记录也将被法院审查。
- 行政违法记录：虽然检察院的不起诉决定本身不产生犯罪记录，但若行为涉及行政违法，可能会留下行政处罚记录。这些记录在特定情况下（如政审等）可能被视为一种“案底”，但与犯罪记录有本质区别。
三、法律建议与注意事项
- 了解不起诉决定的法律效力：检察院的不起诉决定具有终止刑事诉讼的效力，意味着案件在审查起诉阶段终结，不再进入审判程序。然而，这并不意味着所有记录都会被“封存”或消除。
- 关注特定行业或职业的要求：在某些行业或职业中，即使检察院作出不起诉决定，相关单位可能根据内部规定进行一定处理或记录。因此，在涉及此类行业或职业时，应提前了解相关规定并做好准备。
- 咨询专业律师：对于具体案件是否会留下记录或产生其他法律后果，建议直接向我咨询。作为专业律师，我可以根据案件的具体情况和相关法律法规提供针对性的法律意见和帮助。
综上所述，检察院不起诉的案件通常不会直接“封存”整个案件，而是根据不起诉的类型及具体情形作出相应处理。如有任何疑问或担忧，请直接向我咨询以获取更准确的法律意见和帮助。