撞了人逃逸后又自首，保险公司是否会赔偿，这个问题涉及到交强险和商业险的不同处理方式，以及具体案件情况和保险合同的约定。

首先，从交强险的角度来看，根据《机动车交通事故责任强制保险条例》，被保险机动车发生道路交通事故造成受害人的人身伤亡、财产损失，保险公司应在交强险责任限额范围内予以赔偿。这意味着，即使驾驶人肇事逃逸后自首，交强险通常仍需在责任限额内进行赔偿，除非存在法定免责情形，如驾驶人醉酒、无证驾驶等。

其次，对于商业险部分，情况则相对复杂。商业险的赔偿通常依据保险合同的约定来确定。如果保险合同中明确将肇事逃逸列为免责条款，并且保险公司已经对该免责条款向投保人履行了提示和明确说明义务，那么保险公司在商业险范围内有权拒绝赔偿。然而，如果保险合同没有明确约定肇事逃逸为免责条款，或者保险公司未能充分履行提示和说明义务，那么保险公司仍需在商业险限额内进行赔偿。

综上所述，撞了人逃逸后又自首，保险公司是否会赔偿取决于多个因素，包括交强险和商业险的具体条款、法定免责情形以及保险合同的约定等。因此，在处理此类问题时，建议被保险人及时查阅保险合同条款，并与保险公司进行沟通协商。如果双方对赔偿事宜存在争议，可以通过协商、仲裁或诉讼等方式解决。