针对您提出的“农村里养五千只鸡以上且距离环保村庄不到100米，涉及行政诉讼应如何处理”的问题，以下是我的专业分析：

1. 明确法律关系和法律依据：

   • 首先，需要明确养殖活动是否违反了相关的环保法律法规，如《环境保护法》、《畜禽规模养殖污染防治条例》等。
   • 若养殖活动确实存在环境污染问题，且对周边村庄居民的生活造成了影响，那么相关部门有权依法进行处罚或要求整改。

2. 分析行政诉讼的可行性：

   • 若您（或您的客户）认为相关部门的处罚或整改要求不合法或不合理，可以考虑提起行政诉讼。
   • 在提起行政诉讼前，建议充分收集证据，包括养殖活动的合法性证明、环境污染程度的评估报告、相关部门处罚或整改要求的文书等。

3. 行政诉讼的具体步骤：

   • 准备阶段：确定诉讼主体，明确诉讼请求和事实理由，收集并整理证据材料。
   • 起诉阶段：向有管辖权的人民法院提交起诉状及证据材料，并缴纳诉讼费。
   • 审理阶段：参与法庭调查、辩论，对争议焦点进行阐述和论证。
   • 判决阶段：等待法院作出判决，并根据判决结果决定是否上诉或执行。

4. 注意事项：

   • 在整个行政诉讼过程中，务必遵守法律程序，尊重法院的判决结果。
   • 若对法律程序或法律规定不熟悉，建议聘请专业律师进行代理，以确保诉讼的顺利进行。

5. 其他建议：

   • 在养殖活动中，应严格遵守环保法律法规，确保养殖活动的合法性和环保性。
   • 若与周边村庄居民发生纠纷，应积极沟通协商，寻求和解或调解的方式解决争议。

综上所述，处理此类行政诉讼案件需要明确法律关系和法律依据，分析行政诉讼的可行性，并按照法律程序进行具体操作。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。