去公司应聘体检不合格的费用通常由应聘者自己承担。以下是对此问题的详细分析：

一. 体检费用的承担原则

通常情况下，体检费用是由应聘者自己承担的。这是因为体检是应聘者为了证明自己身体状况符合岗位要求而进行的个人行为，其结果直接关乎应聘者能否被录用。从公平和合理的角度来看，体检费用应由应聘者个人承担。

二. 体检不合格的处理

如果应聘者在体检中被发现存在不符合岗位要求的健康问题，公司通常会拒绝录用。在这种情况下，由于应聘者并未被正式录用，因此公司没有义务为其承担体检费用。即使应聘者已经垫付了体检费用，公司也一般不会给予报销。

三. 特殊情况

虽然一般情况下体检费用由应聘者承担，但也存在一些特殊情况。例如，有些公司可能会在招聘过程中明确承诺，无论体检结果如何，都会为应聘者承担体检费用。此外，如果应聘者在体检过程中发现存在健康问题，但这些问题并不影响其从事该岗位的工作，且公司仍然决定录用该应聘者，那么公司可能会出于人道主义考虑，主动承担部分或全部体检费用。然而，这些情况并不常见，且具体做法会因公司政策和实际情况而有所不同。

四. 法律依据

虽然法律没有直接规定入职体检费用的报销问题，但《中华人民共和国劳动合同法》第九条明确规定了“用人单位招用劳动者，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物”。这意味着，企业不应以此为由向员工收取费用。然而，这并不意味着企业必须承担所有情况下的体检费用。

综上所述，去公司应聘体检不合格的费用通常由应聘者自己承担。但具体情况还需根据公司的招聘政策以及实际情况来判断。我建议应聘者在参加入职体检前，与公司明确相关费用报销事宜，以避免后续纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。