政府部门应急抢修后，确实可以向实际责任主体行使追偿权。以下是对这一结论的详细阐述：

首先，从法律原则上来看，当政府部门为了公共利益或紧急情况下进行应急抢修时，其行为往往属于无因管理或紧急避险的范畴。在这些情况下，政府部门虽然承担了本不应由其承担的责任和义务，但这也为其后续向实际责任主体追偿提供了法律依据。

其次，从实际操作层面来看，政府部门在应急抢修过程中会投入大量的人力、物力和财力。这些资源的消耗，理应由造成紧急情况或需要抢修的实际责任主体来承担。因此，政府部门在抢修完成后，有权向实际责任主体提出追偿要求，以弥补其因抢修而遭受的损失。

此外，需要注意的是，政府部门在行使追偿权时，应遵循相关法律法规和程序规定。例如，需要确保追偿的金额或资源消耗与实际情况相符，避免过度追偿或不当追偿的情况发生。同时，政府部门也应积极与实际责任主体进行沟通和协商，以寻求合理的解决方案。

综上所述，政府部门在应急抢修后向实际责任主体行使追偿权是合法且合理的。这一做法不仅有助于维护公共利益和公平正义，也能有效保障政府部门的合法权益和资源投入得到合理回报。