针对您提出的问题“后期协商一致，合同另行签订是否有效”，以下是我的详细解答：
首先，合同另行签订通常是有效的，但前提是必须满足几个关键条件：
双方真实意愿：另行签订的合同必须是双方自愿、平等协商的结果，不能存在欺诈、胁迫等不正当手段。
合法合规：合同内容必须遵守国家法律法规的强制性规定，不得违法违规，也不能违背社会公序良俗。
与原合同关系：如果另行签订的合同与原合同存在冲突或不一致的地方，一般而言，以另行签订的合同为准，视为对原合同的补充或变更。但这也取决于双方的具体约定和法律法规的规定。
另外，值得注意的是，如果另行签订的合同中包含格式条款，提供方需要遵循公平原则确定双方的权利义务，并采取合理方式提示对方注意关键条款，特别是与对方有重大利害关系的条款。如果提供方未遵循这些原则，那么相关条款可能会被认定为无效。
综上所述，后期协商一致的合同另行签订通常是有效的，但具体效力还需根据合同的具体内容、双方的真实意愿以及法律法规的规定来判断。如果您在签订合同时有任何疑问或不确定的地方，建议咨询专业律师或法律顾问，以确保合同的合法性和有效性。