部队起诉退伍军人现役期间多发补助，法院一般会受理。但具体是否受理，还需根据案件的具体情况以及法院的判断来确定。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据我国《民事诉讼法》的相关规定，只要原告具有诉讼主体资格，有明确的被告，有具体的诉讼请求和事实、理由，并且属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖，那么法院就应当受理。
   • 在这个案例中，部队作为原告，退伍军人作为被告，多发补助作为具体的诉讼请求和事实，如果满足上述条件，法院理应受理。

2. 诉讼主体资格：

   • 部队作为原告，需要证明其是合法的诉讼主体，通常这不会成为问题，因为部队是依法成立的组织，具有诉讼主体资格。
   • 退伍军人作为被告，其身份也是明确的，因此诉讼主体资格方面不存在障碍。

3. 诉讼请求和事实：

   • 部队需要提供充分的证据证明退伍军人在现役期间确实多发了补助，这包括相关的财务记录、发放记录、证人证言等。
   • 诉讼请求应当明确具体，比如要求退伍军人退还多发的补助，或者要求赔偿因此造成的损失等。

4. 法院管辖：

   • 根据《民事诉讼法》的规定，民事诉讼由被告住所地人民法院管辖，或者由合同履行地、侵权行为地等其他与案件有实际联系地点的人民法院管辖。
   • 在这个案例中，如果部队和退伍军人能够就管辖问题达成一致，那么可以选择一个双方都认为合适的法院进行诉讼。如果无法达成一致，则需要根据法律规定来确定管辖法院。

综上所述，部队起诉退伍军人现役期间多发补助，只要满足《民事诉讼法》规定的受理条件，法院一般会受理。但具体结果还需根据案件的具体情况和法院的判断来确定。如果部队有充分的证据证明其诉讼请求和事实，并且选择了正确的管辖法院，那么其诉讼请求就有可能得到法院的支持。