针对农民占用水利局土地的情况，处理方式主要依据相关法律法规及具体实际情况来定。以下是我根据法律实务经验，给出的几个处理建议：

1. 明确土地权属：

   • 首先，需确认该土地的确属于水利局所有，具有合法的土地使用权证明。若权属存在争议，应先通过法律途径解决权属问题。

2. 与农民沟通协商：

   • 在确认权属无误后，可与占用土地的农民进行友好沟通，了解其占用土地的原因和具体情况，尝试通过协商达成和解，如让农民自行拆除或搬离，或给予一定补偿后允许其继续使用（需符合相关法律法规）。

3. 依法采取法律措施：

   • 若协商无果，水利局可依法向当地人民法院提起诉讼，要求农民停止侵占、恢复原状，并赔偿因此造成的损失。在诉讼过程中，应提供充分的证据证明农民的侵占行为及因此造成的损害。

4. 申请强制执行：

   • 若法院作出有利于水利局的判决，但农民仍不履行，水利局可向法院申请强制执行，由法院依法采取很多强制措施，如冻结银行账户、查封财产等，以迫使农民履行判决。

5. 考虑社会影响与和谐稳定：

   • 在处理过程中，也需考虑社会影响与和谐稳定。如农民占用土地系因生活所迫或历史遗留问题，应寻求更加人性化的解决方案，避免激化矛盾。

综上所述，处理农民占用水利局土地的问题需综合考虑法律、社会、经济等多方面因素，采取合法、合理、合情的方式予以解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。