针对您提出的“未及时回复公开信息，收到行政复议如何回复”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，根据《政府信息公开条例》的相关规定，行政机关在收到政府信息公开申请后，应当尽快进行审查，并在规定的时间内给予答复。具体来说，如果能够当场答复，应当当场予以答复；如果不能当场答复，应当自收到申请之日起20个工作日内予以答复。若需要延长答复期限，必须经政府信息公开工作机构负责人同意，并告知申请人，但延长的期限最长不得超过20个工作日。
现在，您提到的情况是行政机关未在规定时间内回复政府信息公开申请，并因此收到了行政复议申请。在这种情况下，行政机关应当采取以下步骤进行回复：
确认复议申请：首先，要仔细审查复议申请材料，确认复议申请的主体、复议请求、事实和理由等是否清晰、完整，并确认复议申请是否在法定期限内提出。
核实原行政行为：接着，要核实原行政行为（即未及时回复政府信息公开申请）的具体情况，包括申请提交的时间、行政机关签收的时间、以及行政机关是否在规定时间内进行了答复等。
准备答复材料：根据核实的情况，准备答复材料。答复材料应当包括：对复议申请的回应、原行政行为的合法性及合理性说明（如有）、未及时回复的原因及改进措施等。
提交答复：在法定期限内，将答复材料提交给复议机关，并确保答复内容真实、准确、完整。
配合复议审理：在复议审理过程中，积极配合复议机关的调查和询问，提供必要的证据和资料。
最后，需要注意的是，如果行政机关确实存在未及时回复政府信息公开申请的情况，并且复议机关确认该行政行为违法，那么行政机关应当依法承担相应的法律责任，并采取措施进行整改，以避免类似情况再次发生。
综上所述，面对行政复议申请，行政机关应当认真审查、核实情况、准备答复材料，并积极配合复议机关的审理工作。同时，也要加强内部管理，提高工作效率，确保在规定时间内回复政府信息公开申请，维护公民的知情权和行政机关的公信力。