工伤认定书被公司拿去后，你依然可以申请劳动能力鉴定。以下是详细的解释和申请流程：

一、申请劳动能力鉴定的依据

根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在发生工伤且伤情相对稳定后，若存在残疾或影响劳动能力的情况，应当进行劳动能力鉴定。这一规定赋予了工伤职工本人或其近亲属直接向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出鉴定申请的权利。因此，即使工伤认定书被公司拿去，你作为工伤职工，依然有权自行申请劳动能力鉴定。

二、申请劳动能力鉴定的条件

1. 工伤认定决定已作出：确保你已经获得了工伤认定书，这是申请劳动能力鉴定的前提。
2. 伤情相对稳定：你的伤情需要得到有效控制，不会因进一步发展而影响劳动能力的评估。通常，这需要咨询主治医生进行确认。

三、申请劳动能力鉴定的流程

1. 准备材料：

   • 填写完整的劳动能力鉴定申请表。
   • 提供有效的诊断证明、检查/检验报告等完整病历材料。
   • 工伤认定决定书原件及复印件。
   • 申请人的有效身份证明原件及复印件。

2. 提交申请：

   • 将准备好的材料提交至用人单位所在地的设区市级劳动能力鉴定委员会。部分地区支持线上申请，建议先电话咨询了解具体流程。

3. 等待审核与安排：

   • 劳动能力鉴定委员会将对提交的材料进行审核，并根据工作安排确定鉴定时间和地点，随后通知你。

4. 参加鉴定：

   • 按照通知的时间和地点，携带相关证件前往指定医疗机构参加鉴定。专家将依据伤残情况、病历资料及现场检查进行综合评估。

5. 领取鉴定结论：

   • 劳动能力鉴定委员会通常在收到申请之日起60日内作出鉴定结论，必要时可延长30日。结论作出后，将及时送达给你。

四、注意事项

• 在整个申请过程中，确保所有提供的材料真实有效，以免影响鉴定结果。
• 若对鉴定过程或结果有任何疑问，可随时咨询当地劳动能力鉴定委员会或向我寻求专业法律帮助。

综上所述，即使工伤认定书被公司拿去，你依然可以按照上述流程申请劳动能力鉴定，以确保自身的合法权益得到合理保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。