针对公司私自扣员工工资的问题，员工可以通过一系列合法途径来维护自己的权益。以下是一步一步的详细解答：

一、初步措施：与公司协商

首先，建议员工与公司的人事或财务部门进行友好协商，尝试了解扣工资的具体原因，并依据《中华人民共和国劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，提出自己的反驳和诉求。这些法律规定用人单位必须按照劳动合同的约定和国家规定，及时足额支付劳动报酬，不得无故克扣或拖欠。

二、向劳动保障行政部门举报

如果与公司协商无果，员工可以向当地的劳动保障行政部门（如劳动管理监察大队）进行举报。举报方式通常包括拨打热线电话12333或直接前往提交书面投诉材料。投诉材料应包含投诉人和被投诉单位的基本信息、投诉请求、事实和理由等，并附上相关证据，如工资条、劳动合同、考勤记录等。

劳动保障行政部门将调查核实投诉事项，若查证属实，将责令公司限期支付克扣的工资，并可能加付赔偿金。

三、申请劳动仲裁

若行政举报未能解决问题，员工可以向当地劳动仲裁委员会申请仲裁。申请仲裁需要提交仲裁申请书，包含申请人和被申请人的基本信息、仲裁请求、事实和理由等，并同样附上相关证据。

劳动仲裁委员会将组织双方进行调解，若调解不成，将进行仲裁裁决。仲裁裁决具有法律效力，公司必须履行。如果公司拒绝履行仲裁裁决，员工可以申请法院强制执行。

四、提起诉讼

如果员工对劳动仲裁结果不满意，可以在收到仲裁裁决书后的法定期限内（通常为15天）向人民法院提起诉讼。提起诉讼需要准备起诉状，明确诉讼请求和事实理由，并提交相关证据。

法院将根据法律规定和事实情况进行审理，并作出判决。如果公司拒绝履行法院判决，员工可以通过法院强制执行程序来维护自己的权益。

五、注意事项

1. 保留证据：在整个维权过程中，员工应保留好所有相关证据，以证明公司私自扣工资的事实。
2. 遵循法律程序：员工应保持冷静和理性，遵循法律程序进行操作，避免采取过激行为。
3. 寻求专业帮助：如有需要，员工可以咨询专业律师或法律援助机构，获取更具体的法律建议和帮助。

综上所述，公司私自扣员工工资是违法行为，员工可以通过与公司协商、向劳动保障行政部门举报、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。