机关事业单位招标文件约定不支付逾期利息一般是有效的，但具体效力还需根据招标文件的具体内容、相关法律法规以及实际情境来综合判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 招标文件的法律性质：

   • 招标文件是机关事业单位作为招标方，向潜在投标方发出的要约邀请，其中包含了招标项目的具体要求、条件以及双方的权利义务等。
   • 招标文件中的条款，包括是否支付逾期利息的约定，通常是招标方基于自身需求和项目特点而设定的，具有一定的法律约束力。

2. 逾期利息的约定：

   • 逾期利息通常是在借款合同或类似金融交易中，因借款人未按期还款而需向出借人支付的额外利息。
   • 在招标文件中，如果明确约定了不支付逾期利息，这通常意味着招标方不希望因延期付款而承担额外的利息负担。

3. 约定的有效性：

   • 根据《民法典》等相关法律法规，当事人有权在合同中约定各自的权利和义务，包括是否支付逾期利息。
   • 因此，只要招标文件中的约定不违反法律法规的强制性规定，且双方均同意该约定，那么不支付逾期利息的约定就是有效的。

4. 实际情境的影响：

   • 在实际操作中，是否支付逾期利息可能还受到其他因素的影响，如项目性质、资金状况、合同条款的具体表述等。
   • 如果招标文件中的约定与后续签订的合同存在冲突，或者因法律法规的变化导致约定无效，那么就需要根据具体情况来判断逾期利息的支付问题。

综上所述，机关事业单位招标文件约定不支付逾期利息在一般情况下是有效的，但具体还需根据招标文件的具体内容、相关法律法规以及实际情境来综合判断。如果你在实际操作中遇到相关问题，欢迎随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。