关于病假一天或三天怎么扣工资的问题，这确实是一个涉及多个因素的问题，包括劳动合同、公司规章制度、当地法律法规以及职工的工龄和休假情况等。以下是对此问题的详细解答：
一、病假工资计算的基本原则
有约定按约定：
- 如果劳动合同、集体合同或公司规章制度中明确规定了病假工资的计算方式和扣除标准，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么应当按照这些规定来执行。
无约定按法定及惯例：
- 在没有明确约定的情况下，病假工资的计算应遵循当地相关法律法规。一般来说，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
- 具体计算时，需先确定日工资（月工资收入÷月计薪天数，月计薪天数一般为21.75天），然后按照不低于最低工资标准80%的比例计算应支付的病假工资。实际扣除的工资则为日工资减去病假工资。
考虑工龄和休假情况：
- 职工疾病或非因工负伤连续休假的时长和工龄会影响病假工资的计发比例。例如，连续工龄不满2年的，可能按本人工资的60%计发；连续工龄满8年及以上的，则可能按100%计发。
二、实际操作建议
查阅合同条款：
- 职工应首先查阅自己的劳动合同和公司的规章制度，了解其中是否有关于病假工资的具体约定。
咨询人事部门：
- 如果劳动合同或规章制度中没有明确规定，或者职工对相关规定有疑问，应及时向用人单位的人事部门咨询，以获取最准确的病假工资计算方式。
了解当地政策：
- 不同地区可能有不同的病假工资政策，职工应了解并遵守当地的法律法规，确保自己的权益得到保障。
三、特殊情形与保障措施
医疗期内的特殊保护：
- 员工处于法定医疗期内时，企业应按照法律规定支付相应的病假工资或疾病救济费，不能随意克扣工资。
用人单位义务：
- 用人单位应依法建立和完善规章制度，确保病假工资扣除方式的合法性和合理性，并保障劳动者的合法权益。
劳动者权益保护：
- 若劳动者认为用人单位扣发工资不合理，可通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
综上所述，病假一天或三天的工资扣除方式并不是一成不变的，而是需要根据劳动合同、公司规章制度、当地法律法规以及职工的工龄和休假情况来综合判断。因此，建议职工在请假前充分了解相关规定，以确保自己的合法权益不受损害。同时，用人单位也应遵循法律法规，合理制定病假工资制度。