农民工工资履约保证保险出险后，赔付的资金不算甲方付款。下面我对这一问题进行详细分析：

一. 保险赔付的性质

1. 保险赔付的来源：农民工工资履约保证保险是一种保险产品，当投保的企业（通常是施工方或乙方）因故无法按时支付农民工工资时，由保险公司根据保险合同进行赔付。
2. 赔付的独立性：保险赔付的资金来源于保险公司，而非甲方（通常指发包方或业主）。因此，这笔资金在性质上属于保险公司的赔付，而非甲方的付款。

二. 甲方付款与保险赔付的区别

1. 支付主体不同：甲方付款是由甲方直接支付给乙方或农民工的工资款项；而保险赔付是由保险公司支付给农民工或乙方的赔偿款项。
2. 支付条件不同：甲方付款通常基于合同约定的支付节点和条件；而保险赔付则基于保险合同的约定和出险情况。
3. 法律性质不同：甲方付款是合同履行的一部分，属于合同之债；而保险赔付则是基于保险合同产生的赔偿义务，属于保险之债。

三. 实际应用中的处理

1. 在会计处理上：保险赔付通常作为营业外收入或应收账款的减项处理，而不应计入甲方的付款。
2. 在合同执行中：即使保险赔付后，乙方仍应继续履行与甲方的合同义务，包括但不限于按时完成工程、保证工程质量等。

我建议在实际操作中，应明确区分甲方付款和保险赔付的性质和来源，确保资金的正确使用和合同的顺利履行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。