若有正当理由，注册商标即使连续三年不使用，也不会被撤销。下面我将对此进行详细分析：

一. 正当理由的界定

1. 法律依据：根据《中华人民共和国商标法》第四十九条第二款的规定，注册商标若“没有正当理由连续三年不使用”，则面临被撤销的风险。但此条款同时暗示，若存在正当理由，则不构成撤销的理由。
2. 正当理由的实例：正当理由通常包括不可抗力、政府政策性限制、破产清算等不可归责于商标权人的客观情形。例如，因自然灾害导致企业暂时停产，或政府出台某项政策限制某类商品的生产和销售，都可能导致商标在一段时间内无法使用，但这些都属于正当理由。

二. 商标使用的必要性

1. 商标的功能：商标的主要功能是区分商品或服务的来源，为消费者提供识别品牌的指引。因此，商标权人应积极使用商标，以发挥其应有的功能。
2. 避免被撤销的风险：若商标长时间不使用，不仅可能面临被撤销的风险，还可能导致商标权人的市场竞争力下降。因此，即使存在正当理由暂时无法使用商标，商标权人也应尽快恢复使用，或考虑采取其他措施（如许可他人使用）来维持商标的有效性。

三. 建议与风险提示

1. 保留证据：若因特殊原因暂时无法使用商标，商标权人应妥善保留相关证据，以证明存在正当理由。例如，因自然灾害导致停产的企业，应保留相关灾害证明和停产通知等文件。
2. 及时恢复使用：一旦特殊原因消除，商标权人应立即恢复使用商标，并确保其在实际经营中得到有效运用。
3. 提前说明情况：若预计商标将长时间无法使用，商标权人可以提前向商标局说明情况，以降低被撤销的风险。

综上所述，若有正当理由，注册商标即使连续三年不使用，也不会被撤销。但商标权人仍应积极使用商标，并妥善保留相关证据，以避免不必要的法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。