冒名借款合同起诉法院后，不能通过调解确认合同无效。以下是具体的法律分析：

一. 冒名借款合同的性质

1. 冒名行为的定义：冒名行为是指冒名者以他人名义与第三方签订合同，而被冒名者对此并不知情。在此情况下，被冒名者并非合同当事人，合同中的权利义务对其不产生法律效力。
2. 合同效力的判断：根据《民法典》的相关规定，合同的效力取决于合同当事人的真实意思表示。由于冒名行为中，被冒名者并未表达真实意思，因此合同自始无效。

二. 调解的适用范围

1. 调解的定义：调解是在人民法院审判人员的主持下，双方当事人通过自愿协商，达成协议，解决民事争议的活动和结案方式。
2. 调解的适用条件：调解通常适用于双方当事人对争议事实存在争议，但愿意通过协商达成和解的情况。然而，对于合同效力等法律问题的判断，属于人民法院的职权范围，不能通过调解来改变。

三. 冒名借款合同的处理方式

1. 法院审理：对于冒名借款合同纠纷，人民法院将依法进行审理，并根据查明的事实作出判决。
2. 合同无效的确认：如果法院认定合同存在冒名行为，将依法确认合同无效。这一判断是基于法律对合同效力的规定，而非双方当事人的协商结果。

综上所述，冒名借款合同起诉法院后，不能通过调解来确认合同无效。因为合同的效力是由法律规定的，而非双方当事人可以通过调解来改变的。如果合同存在冒名行为，人民法院将依法确认合同无效。如有进一步需要，您可以继续咨询我。