员工擅离职守，单位有权依据具体情况采取相应的处理措施。以下是对此问题的全面分析：
一、核心结论
员工擅离职守，单位可以依据内部规章制度给予警告、扣发绩效奖金等处罚；若造成经济损失，有权要求员工赔偿；情节严重的，可以解除劳动合同且无需支付经济补偿金。对于公职人员，擅离职守还可能面临纪律处分，甚至被追究法律责任。
二、具体处理措施
轻微擅离职守：
- 单位可以依据内部规章制度，如员工手册，给予警告、扣发一定数额的绩效奖金等处罚措施。
造成经济损失：
- 若因擅离职守给单位造成经济损失，单位有权要求员工赔偿相应损失。损失赔偿可以从员工工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。
多次或情节严重：
- 对于多次擅离职守或情节严重的员工，单位可以解除劳动合同且无需支付经济补偿金。
公职人员擅离职守：
- 公职人员擅离职守的，一般会按照公职人员的纪律处分条例，可能会面临警告、记过、降职、撤职等不同程度的处分。情节特别严重的，可能被开除公职。若其擅离职守导致重大损失或严重后果，还可能面临法律的追究。
三、法律依据
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，劳动者严重违反用人单位规章制度的，用人单位有权解除劳动合同。擅离职守通常被视为严重违反规章制度的行为之一。
四、实际案例
- 在实际案例中，有员工因擅离职守导致生产事故，单位依据规章制度解除了其劳动合同，并要求其赔偿因此造成的经济损失。该员工最终接受了处罚，并承担了相应的赔偿责任。
五、建议与提醒
- 对于员工而言，应严格遵守单位的规章制度和劳动纪律，避免擅离职守等违纪行为的发生。
- 对于单位而言，应建立健全的规章制度和考核机制，对擅离职守等行为及时纠正和处理，以维护单位的正常生产经营秩序和员工的合法权益。
综上所述，员工擅离职守是违反劳动纪律和单位规章制度的行为，单位有权依据具体情况采取相应的处理措施。希望员工能够自觉遵守劳动纪律和单位规章制度，共同维护良好的工作环境和秩序。