甲方要发现总包是否存在违法转包行为，可以从以下几个方面进行细致的调查和审计：

一、查合同文本

首先，应详细审查总分包合同。重点关注合同中关于工程承包范围、工程量、施工要求、转包与分包条款等关键内容。特别是要留意合同中是否有明确禁止转包或违法分包的条款，以及总承包单位是否存在将工程全部或支解后转包给第三人的行为。

二、查工程现场管理资料

通过审查工程现场管理资料，如施工日志、监理日志、验收报告等，可以了解实际施工情况与合同约定是否一致。重点比对招标文件上列出的关键人员（如项目经理、技术负责人等）是否与实际施工现场人员一致，签字笔迹是否相符，是否存在后补或伪造情况。同时，关注实际完成内容与合同约定是否一致，变更设计是否经过审批，分部验收意见是否真实等。

三、查材料供应与资金流向

1. 材料供应：询问工程建筑材料、设备等物资的购买主导方，了解施工队伍是否由承包单位组建，以及项目部或分公司临时开设的账户及公章等由谁掌控。通过这些信息，可以初步判断工程是否存在转包或违法分包行为。
2. 资金流向：重点关注中标单位的财务账簿、会计凭证和银行账户流水单。查看中标单位收到工程款后的资金变动情况，特别是“预收账款”和“应收账款”科目的资金流动。如果中标单位在收到工程款后，扣除一定管理费用后大额转出给其他单位或个人，那么很可能存在转包行为。同时，核对银行账户上收到的工程款总额与法人单位支付的工程款总额，查看工程款主要去向是否符合常理。

四、详细勘察工程现场

通过实地查看工程现场，可以与设计图纸进行对比，观察是否存在较大差异。在查看过程中，建议要求设计方、施工方、监理方、项目法人等共同参与，对出现的问题或疑惑进行实时交流、求证，并形成查看结果清单，由所有参与方签字认可。这样既可以提高现场查看的成效，也能防止事后出现争议。

五、利用审计技巧与多方谈话

1. 审计技巧：如利用12345热线和信访举报信件等渠道，按照特定关键词（如工程款、材料款、农民工工资等）进行检索，从中找出拖欠工程款的施工标段或施工主体，进而侧面询问项目实际施工情况，寻找转包、违法分包的疑点线索。
2. 多方谈话：与项目法人单位、施工单位、监理单位等进行谈话，通过政策攻心、证据揭示、矛盾追踪等方法，引导他们如实说明项目实施过程中的真实情况。特别是要注意施工单位在谈话时可能存在的抵触情绪和不配合行为，应充分利用已经掌握的证据进行揭示和印证。

综上所述，甲方要发现总包是否存在违法转包行为，需要综合运用合同审查、现场管理资料审查、材料供应与资金流向审查、工程现场勘察以及审计技巧与多方谈话等多种手段。通过这些方法的综合运用，可以更有效地揭露和打击违法转包行为。