税务行政处罚可以适用裁量积分制，但具体是否适用以及如何适用，取决于相关的税务法规、政策以及具体的裁量基准制度。

近年来，为规范税务行政处罚裁量权的行使，保护纳税人、扣缴义务人及其他涉税当事人的合法权益，国家税务总局以及各省（直辖市）税务局先后出台了税务行政处罚裁量权实施办法、执行标准，并初步建立了税务行政处罚裁量基准制度。这些制度对税务行政处罚的裁量进行了细化和规范，以确保处罚的公正性和合理性。

裁量基准制度通常根据违法行为的事实、性质、情节以及社会危害程度等因素，划分不同的裁量阶次，并设定相应的处罚标准。税务机关在行使处罚权时，必须严格遵守这些裁量基准，确保处罚决定在法定幅度内，并符合立法目的和合理性原则。

因此，在实际操作中，税务机关会根据具体的税务法规、政策以及裁量基准制度，对税收违法行为进行裁量，并决定是否适用裁量积分制。如果适用裁量积分制，税务机关会按照既定的积分规则和标准，对违法行为进行积分，并根据积分结果确定相应的处罚措施。

总之，税务行政处罚是否适用裁量积分制，以及如何适用，都需要依据具体的税务法规、政策和裁量基准制度来确定。如果您对具体的税务行政处罚有疑问或需要进一步的咨询，建议咨询专业的税务机构或律师以获取准确的解答。