当您遇到申请工伤但单位不配合的情况时，可以采取以下步骤来维护自己的合法权益：

一、自行申请工伤认定

1. 时间要求：在事故伤害发生之日起1年内，向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
2. 准备材料：
   • 劳动关系证明：如劳动合同、工资支付记录（银行流水）、工作证、考勤记录等。
   • 工伤发生相关证据：包括事故发生的时间、地点、经过等证明材料，如现场照片、视频、证人证言以及医疗机构的诊断证明。
3. 提交申请：将准备好的材料提交给社会保险行政部门，并等待其进行审核调查。

二、申请劳动仲裁

1. 准备材料：
   • 仲裁申请书：详细陈述申请事项、事实和理由，明确请求公司支付的工伤赔偿项目和金额。
   • 相关证据材料：包括劳动关系证明、工伤认定决定书、医疗费用单据、伤残等级鉴定报告等。
2. 提交申请：将仲裁申请书和相关证据材料提交给劳动争议仲裁委员会。
3. 参与仲裁庭审：在仲裁过程中，积极配合仲裁庭的调查和询问，如实陈述事实，并提供证据支持自己的主张。
4. 执行仲裁裁决：如果仲裁委员会作出裁决支持您的诉求，但公司仍然不履行支付义务，您可以向有管辖权的人民法院申请强制执行。

三、向劳动监察部门投诉

1. 投诉方式：可以拨打当地劳动监察部门的投诉电话，或者直接到劳动监察部门办公场所进行现场投诉。
2. 提供信息：在投诉时，详细说明公司的违法行为，如拒绝配合工伤认定、不支付工伤赔偿等情况，并提供相关证据材料。
3. 跟进处理结果：劳动监察部门会对投诉进行调查处理，您可以定期了解处理进度，确保问题得到妥善解决。

四、寻求法律援助或咨询专业律师

如果您在维权过程中遇到法律难题或需要专业指导，可以向当地的法律援助机构申请法律援助，或者自行咨询专业的劳动法律师。他们可以根据您的具体情况提供专业的法律建议和解决方案。

总之，面对单位不配合申请工伤的情况，您要积极主动维权，通过自行申请工伤认定、申请劳动仲裁、向劳动监察部门投诉以及寻求法律援助或咨询专业律师等途径来维护自己的合法权益。同时，也要注意留存相关证据材料，以便在维权过程中使用。