结论前置：土地规划许可面积超出土地合同面积，属于违反规划条件的行为，将可能面临责令停止建设、限期改正、罚款、限期拆除甚至没收实物或违法收入等法律后果。具体处理需根据超出的面积大小、对规划的影响程度以及相关法律法规的规定来决定。

分析说明：

1. 法律法规依据：

   • 《中华人民共和国城乡规划法》：明确规定建设单位或个人应按照规划条件进行建设，未经规划部门许可擅自超建，属于违法建设行为。
   • 《城市房地产开发经营管理条例》：要求开发企业按规划设计条件开发建设，超规划建筑面积将影响项目的竣工验收和产权登记。
   • 地方具体规定（如面积标准）：使用不同类型土地进行建设的面积限制，超出部分以非法占用土地论处。
   • 《土地管理法》：对于非法占用土地的行为，规定了责令退还、限期拆除、恢复土地原状、没收建筑物及并处罚款等处罚措施。

2. 处理流程与后果：

   • 认定主体：由城乡规划主管部门负责超规划建筑面积的认定。
   • 调查取证：收集相关证据，确定超建面积及影响。
   • 分类处理：
     • 尚可改正：超建部分对规划实施影响小，可限期改正并处以罚款，整改后补办手续。
     • 无法改正：严重影响规划实施，责令限期拆除；不能拆除的，没收实物或违法收入，并处罚款。
   • 产权登记与交易影响：超规划建筑面积部分通常无法直接办理产权登记，可能影响房屋的交易和价值评估。

3. 特殊情况处理：

   • 在某些情况下，如果超规划建筑面积不大且符合一定条件，可能会在土地登记簿和权利证书记事栏内注明超出面积数，待以后分户建房或拆迁翻建时再行处理。但这并不意味着超建行为被合法化，仍需按照相关规定进行处理。

法律建议：

• 在进行土地开发和建设时，务必严格遵守规划条件，确保建筑面积不超出合同约定的范围。
• 如已存在超建问题，应积极配合相关部门的认定和处理工作，及时采取措施进行整改和补救。
• 对于涉及的法律问题和后续处理流程，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和帮助。

行动指南：

• 自查自纠：首先自查是否存在超建行为，如有，请立即停止并寻求专业法律意见。
• 配合调查：如收到相关部门的调查通知，请积极配合并提供所需资料。
• 整改补救：根据相关部门的处理意见，及时采取整改和补救措施，以减轻法律后果。