车库改商铺的合法性需根据具体情况判断，但一般情况下，未经相关部门审批擅自改变车库用途和结构是不合法的。以下是对这一问题的详细分析：
一、改变房屋用途的合法性分析
规划法规约束：
- 车库在建设时即已确定其规划用途为停放车辆，根据《中华人民共和国城乡规划法》及相关法律法规，未经规划部门批准，擅自改变建筑物规划用途（如将车库改为商铺）是违法的。
小区管理规定：
- 小区的《业主公约》或《物业服务合同》通常明确规定业主不得擅自改变房屋用途和结构。车库改商铺可能影响小区环境、秩序和其他业主权益，从而违反小区管理规定。
二、建筑结构安全的合法性分析
结构改造规定：
- 依据《建设工程质量管理条例》，涉及建筑主体和承重结构变动的装修工程，需施工前委托专业设计单位提出设计方案，并经过审批。车库改商铺过程中若涉及结构改造，未经专业设计和审批将危及建筑物整体结构安全，属于违法行为。
安全隐患风险：
- 擅自改变车库结构可能导致建筑稳定性受损，增加安全隐患，威胁居民生命财产安全。
三、消防和安全的合法性分析
- 车库与商铺在消防设计和安全要求上存在显著差异。根据《中华人民共和国消防法》，公众聚集场所投入使用前需通过消防安全检查。车库改商铺后，若未按商铺消防标准进行改造和设置消防设施，将无法满足消防安全要求，存在严重安全隐患，违反消防法规。
四、合法改造的途径与难度
- 虽然理论上可以通过相关部门的审批，按程序完成规划变更、消防审批、结构安全评估等手续，使改造后的商铺符合法律法规和安全标准，从而成为合法改造。但在实际操作中，这种审批通过的难度较大，需要满足严格的条件和标准。
五、总结与建议
综上所述，车库改商铺的合法性取决于是否经过了相关部门的审批和是否符合各项法律法规及安全标准。在未获得审批和满足相关条件的情况下，擅自进行改造是违法的，可能面临法律制裁和安全隐患。
因此，我强烈建议在进行此类改造前，务必咨询专业人士（如我这样的专业律师），了解清楚法律规定，并严格按照法定程序进行申报和审批。如果你有任何关于房产纠纷、刑事辩护、离婚或离婚财产纠纷等方面的法律问题，都可以直接向我咨询。