被查封的车辆不履行判决义务时，即使车辆有抵押，法院也有权进行扣押。以下是对此问题的详细分析：

1. 查封与扣押的关系：

   • 查封是法院为了保障判决的执行，对被执行人的财产采取的一种限制性措施，防止财产被转移或隐匿。
   • 扣押则是法院在特定情况下，如被执行人未履行判决义务，对被执行人的财产采取的一种更为强制性的措施，以便进一步处理（如拍卖、变卖等）来履行判决。

2. 抵押对扣押的影响：

   • 抵押是债务人或第三人为担保债务的履行，将财产设定给债权人作为担保的行为。
   • 抵押权的存在并不妨碍法院对财产的查封和扣押。因为法院的查封和扣押是基于判决的执行，而抵押权是基于债权债务关系。
   • 在扣押后，法院会按照法律程序处理被扣押的财产，包括考虑抵押权的存在和优先受偿权。

3. 法律程序与后续处理：

   • 如果车辆被查封后，被执行人仍未履行判决义务，法院有权决定扣押车辆。
   • 扣押后，法院会通知抵押权人等相关方，并按照法律程序对车辆进行处理（如评估、拍卖等）。
   • 在处理过程中，抵押权人的权益会得到相应的保障，如优先受偿等。

综上所述，即使车辆有抵押，如果被执行人未履行判决义务，法院仍有权对车辆进行扣押。如果你面临类似情况或有其他法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。