在公司自愿清算的过程中，如果小股东不同意，那么清算程序可能会受到一定影响，但并非无法进行。具体分析如下：

1. 公司自愿清算的决策机制：

   • 公司自愿清算通常需要由股东会作出决议。根据《公司法》的相关规定，股东会决议的通过通常需要代表一定比例的表决权的股东同意。
   • 如果公司章程或股东协议中有特别约定，如关于清算的特别决议程序，那么应遵循这些特别约定。

2. 小股东不同意的影响：

   • 如果小股东所持表决权比例较小，不足以阻止清算决议的通过，那么清算程序仍可进行。此时，小股东的意见虽被记录，但不影响最终决策。
   • 如果小股东所持表决权比例较大，足以阻止清算决议的通过，或根据公司章程、股东协议的特别约定，小股东有阻止清算的权利，那么清算程序将无法进行，除非能与小股东达成一致意见或修改相关约定。

3. 解决方案：

   • 协商：与小股东进行充分沟通，了解其不同意的原因，尝试达成一致意见。可以通过提供合理的补偿、安排其在清算后的公司中的权益等方式，争取其支持。
   • 修改公司章程或股东协议：如果可能，可以修改公司章程或股东协议中关于清算的特别约定，以降低小股东阻止清算的门槛。
   • 法律途径：如果协商无果，且小股东的行为严重阻碍了公司的正常清算程序，可以考虑通过法律途径解决争议，如提起股东诉讼等。

4. 注意事项：

   • 在处理此类问题时，应严格遵守相关法律法规和公司章程的规定，确保程序的合法性和正当性。
   • 应充分尊重小股东的权益和意见，尽量通过协商和沟通解决问题，避免不必要的法律纠纷。

综上所述，公司自愿清算过程中小股东不同意是一个需要谨慎处理的问题。应根据具体情况分析小股东不同意的影响，并尝试通过协商、修改公司章程或股东协议、法律途径等方式解决问题。如果你在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。