约定了商户承担公摊水电费，在符合一定条件下是合法的。具体分析如下：
合同约定是关键：若在商户与开发商、物业公司等签订的租赁合同或服务协议中，有明确约定公摊水电费的收取方式、标准等内容，并且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么按照合同约定收取公摊水电费就是合法的。因为合同遵循意思自治原则，双方自愿达成的约定具有法律效力。
无约定则可能不合法：如果合同中没有相关约定，物业公司自行决定收取公摊水电费，这就可能侵犯了商户的合法权益，商户有权拒绝支付。此时，物业公司擅自收取公摊水电费的行为可能不合法。
收费应合理透明：即便合同中有约定，收取的公摊水电费也应合理、透明。物业公司需定期公布公摊水电费的使用情况和明细，接受商户的监督。如果收费不合理或不透明，商户可以通过向业主委员会反映、向相关部门投诉等方式来维护自身权益。
综上所述，约定了商户承担公摊水电费是否合法，主要取决于合同中是否有明确且合法的约定。如果有约定且合理透明，那么就是合法的；如果没有约定或约定不合法、不合理，那么商户有权拒绝支付。如果你在这方面遇到了具体问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议和帮助。