对抗组织审查和自动投案在一般情况下是相互矛盾的，通常不会同时认定。下面我对此进行详细分析：
一. 对抗组织审查的认定
定义与性质：对抗组织审查，是指行为人采用各种手段，如提供虚假情况、隐瞒事实真相、销毁或伪造证据等，以阻挠、干扰、破坏党组织或有关国家机关对其进行的审查、调查或处理。这是一种严重的违纪违法行为，通常与贪污、腐败、滥用职权等违法犯罪行为紧密相关。
法律后果：根据相关法律法规，如《中国共产党纪律处分条例》等，对抗组织审查的行为人会受到相应的纪律处分或法律制裁，包括但不限于警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍等，甚至可能面临刑事责任。
二. 自动投案的认定
定义与性质：自动投案，是指犯罪嫌疑人或被告人在其犯罪行为被司法机关发觉或尚未被发觉时，主动向司法机关、公安机关或其他有关机关投案，并如实供述自己的犯罪事实。这是自首的一种表现，是犯罪嫌疑人或被告人认罪悔过、接受法律制裁的积极态度。
法律后果：根据《中华人民共和国刑法》等相关法律，自动投案并如实供述自己罪行的，可以从轻或减轻处罚。这是法律对自首行为的鼓励和肯定，旨在促进犯罪嫌疑人或被告人主动认罪、悔罪，减少社会危害。
三. 对抗组织审查与自动投案的关系
相互排斥：从定义和性质上看，对抗组织审查和自动投案是两种截然不同的行为。对抗组织审查是阻挠、干扰、破坏审查调查的行为，而自动投案是主动认罪、接受法律制裁的行为。这两种行为在逻辑上是相互排斥的，不可能同时存在于同一案件中。
法律认定：在司法实践中，如果犯罪嫌疑人或被告人先对抗组织审查，后又自动投案，司法机关会根据其整体行为表现、认罪态度、社会危害程度等因素进行综合评估。但通常情况下，对抗组织审查的行为会被视为一种严重的负面情节，影响自首的认定和从宽处罚的幅度。
综上所述，对抗组织审查和自动投案在一般情况下是相互矛盾的，不会同时认定。如果犯罪嫌疑人或被告人有对抗组织审查的行为，通常会面临更严厉的处罚；而自动投案并如实供述自己罪行的，则可以从轻或减轻处罚。两者在法律后果上有着明显的区别。如有进一步需要，您可以继续咨询我。