原告对其申请的调查取证的证据，确实需要发表质证意见。以下是对此问题的详细解释：

首先，根据《最高人民法院关于修改<关于民事诉讼证据的若干规定>的决定》第四十七条，证据应当在法庭上出示，并由当事人质证。未经质证的证据，不能作为认定案件事实的依据。这一规定明确了质证在民事诉讼中的重要性，以及未经质证证据的法律效力。

具体到原告申请的调查取证证据，虽然这些证据是由法院根据原告的申请而调查收集的，但它们仍然属于证据的一种，同样需要接受质证的程序。在庭审过程中，原告需要对其申请的调查取证证据进行出示，并由被告、第三人等当事人进行质证。通过质证，可以确保证据的真实性、合法性和关联性，从而保障诉讼的公正性和准确性。

因此，原告在对其申请的调查取证证据进行质证时，应当认真准备，充分发表自己的意见和看法。如果原告对质证程序或证据本身有任何疑问或异议，应当及时提出，并与法庭和其他当事人进行充分的沟通和讨论。

综上所述，原告对其申请的调查取证的证据确实需要发表质证意见，这是民事诉讼程序中的重要环节，也是保障诉讼公正性和准确性的必要措施。