货运经营者擅自改装已取得车辆营运证的车辆，将由县级以上道路运输管理机构或县级以上地方人民政府交通运输主管部门责令改正，并处以5000元以上2万元以下（或3万元以下，具体依据当地法规执行）的罚款。

分析说明：

1. 法规依据：根据《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定，客运经营者、货运经营者擅自改装已取得车辆营运证的车辆，是违反条例的行为。

2. 处罚主体：该条例明确规定了处罚的主体为县级以上道路运输管理机构或县级以上地方人民政府交通运输主管部门，具体执行时可能因地区而异。

3. 处罚措施：对于此类违法行为，处罚措施包括责令改正和罚款。罚款的具体数额根据条例规定为5000元以上2万元以下，但某些地区可能根据当地实际情况有所调整，最高可达3万元。

4. 执行流程：一旦发现有货运经营者擅自改装车辆，相关部门将首先责令其改正违法行为，并根据情节轻重处以相应罚款。

法律建议：

• 对于货运经营者而言，应严格遵守国家法律法规，不得擅自改装已取得车辆营运证的车辆，以免面临法律处罚。
• 如因特殊需要需对车辆进行改装，应事先咨询相关部门并办理合法手续。
• 若收到相关部门的处罚通知，应积极配合整改并按时缴纳罚款，以免影响正常运营。

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