民事判决书不予认定，并非直接等同于否认了对方的证据，而是指法院在综合审查判断后，未将某些证据所支持的事实作为判决的依据。具体分析如下：
一. 不予认定的含义
证据审查过程：在民事诉讼中，法院会对双方当事人提交的证据进行全面的审查，包括证据的真实性、合法性、关联性等。这一审查过程是为了确保判决所依据的事实是清楚、确凿的。
不予认定的情形：如果某些证据存在瑕疵，如真实性无法确认、与案件无直接关联或违反法律规定等，法院在判决书中可能会对这些证据不予认定。这意味着，这些证据所支持的事实不会被法院采纳为判决的依据。
二. 不予认定与否认证据的区别
不予认定：是法院在证据审查过程中的一种判断，它仅仅表明法院未将某些证据作为判决的依据，而并未直接对证据本身的价值或真实性作出否定评价。
否认证据：则是对证据本身的一种直接否定，意味着该证据在诉讼中失去了证明力。但法院在判决书中不予认定某些证据，并不等同于直接否认了这些证据。
三. 不予认定的法律后果
对判决的影响：法院不予认定的证据所支持的事实，将不会被纳入判决所依据的事实范围。这可能会影响判决的结果，因为法院将基于已认定的证据和事实来作出判决。
对当事人的影响：对于当事人而言，如果其提交的证据被法院不予认定，可能需要承担不利的法律后果。但当事人仍有权通过上诉、申请再审等法律途径进行救济。
综上所述，民事判决书不予认定并非直接否认了对方的证据，而是指法院在综合审查判断后，未将某些证据所支持的事实作为判决的依据。当事人在面对这种情况时，应仔细分析法院不予认定的理由，并考虑是否通过法律途径进行救济。如有进一步需要，您可以继续咨询我。