关于您提出的“付款协议书约定了付款时间，主合同关于质保金的约定还有效吗”的问题，以下是我的详细解答：

首先，结论前置：付款协议书约定了付款时间，并不直接决定主合同中关于质保金的约定是否有效。两者之间的有效性需要具体分析合同内容和相互关系。

接下来，我将从几个角度进行详细分析：

1. 合同独立性原则：

   • 付款协议书通常是针对特定款项的支付而订立的，它可能作为主合同的一个补充协议或独立协议存在。
   • 主合同中的质保金约定，通常与产品的质量保证、售后服务等条款相关联，有其独立的法律意义。
   • 因此，付款协议书的存在并不自动使主合同中的质保金约定失效。

2. 合同条款的冲突与解释：

   • 如果付款协议书与主合同在质保金方面存在直接冲突（例如，付款协议书明确排除了质保金的适用），则需要根据合同解释的原则来确定哪个条款优先。
   • 在没有明确冲突的情况下，两者可以并行不悖，各自发挥其法律效力。

3. 质保金的性质与目的：

   • 质保金通常是为了确保产品或服务的质量而设立的一种保证金制度。
   • 即使付款协议书约定了付款时间，如果主合同中的质保金条款仍然符合双方的真实意思表示，并且没有违反法律法规的强制性规定，那么该条款仍然有效。

4. 实际履行情况：

   • 在实际履行过程中，双方可能会根据具体情况对质保金的支付和使用进行协商和调整。
   • 如果双方在实际履行中达成了新的合意，并且该合意与付款协议书和主合同中的相关条款不冲突，那么该合意也应被视为有效。

综上所述，付款协议书约定了付款时间，并不直接决定主合同中关于质保金的约定是否有效。两者之间的有效性需要根据合同的具体内容、相互关系以及实际履行情况来综合判断。如果您在具体案件中遇到此类问题，建议仔细审查合同文本，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。