对于事业单位人员迟到早退100次的情况，单位有权依据相关法律法规及内部规章制度采取相应处理措施，包括但不限于批评教育、通报批评、绩效扣分、扣减奖金、纪律处分等，甚至可能解除劳动合同。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律法规依据

1. 《事业单位人事管理条例》：该条例规定事业单位应建立健全人事管理制度，包括考勤制度。工作人员需遵守单位规章制度，按时上下班是基本工作纪律。对于严重违反工作纪律的行为，单位有权采取相应处理措施。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》及《中华人民共和国劳动合同法实施条例》：虽然未直接规定迟到早退的具体处理，但明确用人单位可因员工“严重违反用人单位的规章制度”解除劳动合同。迟到早退100次显然属于严重违反规章制度的行为，为处理提供了法律依据。

二. 单位内部规章制度的作用

• 事业单位内部规章制度应明确工作时间、考勤办法及对迟到早退的具体处理措施。对于迟到早退100次的情况，单位可根据规章制度直接采取相应处理措施，如绩效扣分、扣减奖金、纪律处分等。

• 处理决定需遵循法定程序，确保合法性和公正性。单位应调查核实迟到早退事实、原因和情节，告知当事人依据、理由和结果，并允许其陈述申辩。

三. 处理建议

1. 依据规章制度处理：单位应严格按照内部规章制度对迟到早退100次的行为进行处理，确保处理方式的公正、合法和合理。

2. 考虑情节严重性：迟到早退100次属于极其严重的违纪行为，单位在处理时应充分考虑其严重性，采取相应严厉的处罚措施，以维护单位的工作秩序和纪律。

3. 加强沟通与教育：在处理的同时，单位也应加强与员工的沟通和教育，提高其时间管理意识和工作纪律性，避免类似情况再次发生。

综上所述，对于事业单位人员迟到早退100次的情况，单位有权依据相关法律法规及内部规章制度采取相应处理措施。我建议单位在处理时应严格遵循法律法规和规章制度，确保处理方式的公正、合法和合理，同时加强制度建设和管理，提升员工的工作纪律性和时间管理能力。如有进一步需要，您可以继续咨询我。