本校副校长与供货商法定代表人存在夫妻关系时，是否可以进行交易需根据具体情况分析，但通常建议避免直接交易以防范风险。

一. 法律法规分析

1. 《中华人民共和国教育法》与《中华人民共和国政府采购法》相关规定：虽然这两部法律并未直接规定学校工作人员与供货商之间的亲属关系是否影响交易，但它们强调了教育资源的公平分配和采购过程的公开、公平、公正。若副校长利用职权为配偶的供货商谋取利益，可能违反这些法律原则。

2. 《中华人民共和国公职人员政务处分法》：该法规定了公职人员利用职权或职务上的影响为本人或他人谋取私利的行为将受到处分。副校长作为公职人员，若其交易行为涉及利益输送，可能触犯此法律。

二. 风险分析

1. 利益冲突风险：副校长与供货商法定代表人存在夫妻关系，可能导致在交易过程中存在利益冲突，难以保证交易的公平性和公正性。

2. 腐败风险：若副校长利用职权为配偶的供货商提供便利，可能引发腐败问题，损害学校利益和社会公信力。

三. 建议措施

1. 避免直接交易：为防范风险，建议学校避免与副校长配偶所代表的供货商进行直接交易。

2. 加强监管：若确有必要进行交易，学校应加强监管，确保交易过程公开、透明，并严格遵守相关法律法规。

3. 建立回避制度：学校可建立回避制度，规定在特定情况下（如涉及亲属关系）副校长应回避相关交易决策。

我的观点：虽然法律法规并未直接禁止副校长与供货商法定代表人存在夫妻关系时进行交易，但考虑到潜在的利益冲突和腐败风险，建议学校采取谨慎态度，避免直接交易或加强监管措施以确保交易的公平性和公正性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。