工程结束后的质保金是不能直接用于支付农民工工资的。质保金是工程完工后，为确保工程质量而扣留的一部分款项，它主要是作为对工程质量的一种保证。只有当工程在质保期内没有出现质量问题，或者承包方已经按照合同约定履行了维修义务后，质保金才会被退还给承包方。

具体来说，质保金的支付流程是：在工程交付并经过一定的质保期后，如果工程没有质量问题，承包方可以向发包方提出返还质保金的申请。发包方在接到申请后，会按照合同约定的内容进行核实，如果无异议，就会在约定的时间内将质保金返还给承包方。

而农民工的工资则是由施工方根据劳动合同的约定来支付的，与质保金没有直接的联系。如果施工方拖欠农民工工资，农民工可以通过法律途径来维护自己的权益，比如向劳动监察部门投诉或者提起劳动仲裁等。

因此，工程结束后的质保金不能用于支付农民工工资，这两者是有明确的区分的。希望这个解释能够帮助您更好地理解质保金和农民工工资的关系。