质保金采用保函后，可以付全部工程款。以下是详细分析：

一. 质保金与工程款的关系

1. 质保金本质：质保金是工程款中的一部分，但其支付、用途和管理具有特殊性，它是发包方为确保工程质量在缺陷责任期内得到维修而从应付工程款中预留的专项资金。
2. 保函的替代作用：当质保金采用保函形式时，承包人无需将现金作为保证金冻结，而是由银行或金融机构出具保函作为担保。这意味着，原本需要预留的现金质保金部分可以转化为保函形式，从而释放了承包人的这部分资金。

二. 保函后的工程款支付

1. 法律支持：根据《建设工程质量保证金管理办法》第三条，发包人与承包人可在合同中约定保证金的预留与返还方式，并未禁止采用保函形式。这为使用保函替代现金保证金提供了明确的法律空间，也意味着在采用保函后，发包人没有理由继续扣留原本应作为质保金的工程款部分。
2. 实际操作：一旦承包人提供了符合要求的保函，发包人应按照合同约定支付剩余的工程款。因为此时，承包人已经通过保函提供了等效的保障，发包人的风险得到了相应的控制。

三. 总结与建议

• 总结：质保金采用保函后，承包人无需再冻结现金作为质保金，这部分资金可以得以释放并用于其他生产经营活动。同时，发包人也获得了与现金质保金相似的保障。因此，在符合合同约定和相关法律法规的前提下，发包人应支付全部工程款。
• 建议：在实际操作中，双方应确保保函的合法性和有效性，并明确保函中的关键信息，如担保范围、金额、有效期等。同时，也建议在合同中明确约定采用保函后的工程款支付方式，以避免潜在的纠纷。

综上所述，质保金采用保函后，发包人可以支付全部工程款。如有进一步需要，您可以继续咨询我。