发现司机偷卖货，应依法追究其刑事责任和民事责任，同时完善内部管理制度。以下是对此问题的详细分析：
一. 证据收集
- 现场证据：若当场发现司机偷卖货，应立即拍摄照片或视频，记录偷卖货的场景、货物状态、数量以及司机的行为。
- 物流信息证据：保存物流单据、货物清单、运输记录等，以证明货物的原始数量和型号，以及司机的运输职责。
- 监控录像：调阅仓库、运输车辆沿途及卸货地点的监控录像，确定偷卖货的时间、地点和过程。
- 证人证言：如有目击者或其他知情人员，应获取其书面或口头的证人证言，以证实司机的偷卖货行为。
二. 法律责任
- 刑事责任：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百六十四条，盗窃公私财物，数额较大的，将处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。若司机偷卖货的行为达到当地盗窃罪的立案标准，公司或个人应及时向公安机关报案。
- 民事责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》第八百三十二条，承运人对运输过程中货物的毁损、灭失承担赔偿责任。因此，司机作为承运人，需向托运人或收货人承担民事赔偿责任。
三. 处理流程
- 报警处理：发现司机偷卖货后，应立即向公安机关报案，配合调查工作并提供相关证据。
- 内部调查：
- 对司机进行询问并记录其陈述，同时核对货物缺失情况，确保实际缺失与证据显示一致。
- 收集运输合同、托运签收单、货物明细等，以证明运输关系和货物价值。
- 法律途径：
- 与司机协商赔偿事宜，若协商不成，可向法院提起民事诉讼，要求司机承担民事赔偿责任。
- 在诉讼过程中，提交收集的证据，证明司机的偷卖货行为及公司的损失金额。
四. 后续管理措施
- 制度完善：审查货物运输、管理等流程，查找漏洞和风险点，完善规章制度，明确各环节的操作规范和责任划分。
- 人员管理：加强司机及其他工作人员的入职审查，定期开展职业道德和法律知识培训，提高员工的法律意识和职业操守。
- 技术防范：增加监控设备、货物追踪系统等技术手段，对货物运输全过程进行实时监控和管理，降低类似事件发生的可能性。
综上所述，发现司机偷卖货后，应依法处理并追究其责任，同时完善内部管理制度以防范类似事件再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。