法院在案件审理结束后，通常会将原告提交的合同原件退还。下面我详细解释一下相关的情况和流程：
一般情况：法院在收取证据原件后，会在案件审结归档时退还当事人。这是法院处理证据原件的常规流程，旨在保障当事人的合法权益，确保原件不会被长期无故扣留。
特殊情况：如果合同原件涉及案件的关键事实，且因长期留存备查等合理事由，法院可能会延迟退还或经当事人申请后退还。在这种情况下，法院会告知当事人延迟退还的原因，并会在合理的时间内或根据当事人的申请退还原件。
当事人的权利：在案件审理过程中，当事人有权向法院提出查阅、复制证据原件的申请，以保障自身的诉讼权利。如果案件审结后较长时间未收到原件退还，当事人可以主动联系承办法官询问情况，维护自身权益。
综上所述，法院在案件审理结束后，通常会退还原告提交的合同原件。但如果存在特殊情况，如原件涉及案件关键事实需要长期留存备查，法院可能会延迟退还。在这种情况下，当事人可以积极与法院沟通，了解自己的权利并维护自身权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。