法院起诉借款合同原件在案件审结后通常会退回。不过，具体退回时间可能会因案件情况而有所不同。下面我为你详细解释：

1. 一般情况下：法院在收取证据原件后，会在案件审结归档时退还当事人。这是为了保障当事人对自身证据材料的完整持有权，使其能够继续妥善保管或基于其他用途合理使用。

2. 特殊情况下：如果借款合同原件关乎案件关键事实，且因长期留存备查等合理事由，法院可能会延迟退还或经申请后退还。在这种情况下，当事人可以在案件审理过程中向法院询问关于证据原件最终的处理情况，以便做好相应准备。

3. 审理过程中的权利：在案件审理过程中，当事人有权向法院提出查阅、复制证据原件等申请，以保障自身诉讼权利。如果案件审结后较长时间未收到原件退还，当事人可以主动联系承办法官询问情况，维护自身权益。

综上所述，法院起诉借款合同原件在案件审结后通常会退回，但具体退回时间可能会因案件情况而有所不同。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。