休完年假后辞职，工资通常不会被扣除。但如果劳动者的年休假天数超过了其应休未休年休假天数，且用人单位有合法有效的书面约定或规章制度规定对多休的年假进行相应处理，则可能会涉及到工资的合理扣除。下面我为您详细分析：
法律依据与劳动者权益：
- 根据《职工带薪年休假条例》及《企业职工带薪年休假实施办法》，职工连续工作1年以上，即可享受带薪年休假。这是法律赋予劳动者的合法权益。休年假期间，劳动者等同于正常出勤，用人单位应保证职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入，不得无故克扣。
特殊情况下的工资扣除：
- 若劳动者实际休假的天数多于按照当年度已工作时间折算应休的年休假天数，且用人单位与劳动者之间有合法有效的书面约定或规章制度明确规定了对多休年假的处理方式（如按日工资收入冲抵多休天数），则在离职时，用人单位可以依据这些规定进行相应处理。但扣除方式必须合理，且必须符合法律法规的规定。
用人单位的义务：
- 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这是用人单位的法定义务，无论劳动者是否休完年假，都不应成为用人单位克扣工资的理由。
劳动者的维权途径：
- 如果用人单位无故克扣工资，劳动者有权通过多种途径维护自己的合法权益。例如，可以与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等。
综上所述，休完年假后辞职，工资通常不会被扣除。但在特殊情况下，如年休假天数超出应休天数且有合法约定或规定时，可能会涉及工资的合理扣除。无论如何，劳动者都应了解自己的权益，并在遇到问题时及时寻求法律帮助。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的解答，请直接向我咨询。