甲方仍需依法履行纳税义务。针对这一问题，我们分析如下：

一. 甲方付工程款与乙方开票行为的关系

1. 付款与开票是两个独立行为：甲方支付工程款是履行其合同义务，而乙方开具发票是其作为收款方的法定义务。两者在法律上是独立的，不能因为乙方的不当行为（如黑开票）而免除甲方的法定责任。
2. 乙方黑开票的法律后果：乙方如果通过非法途径开具发票（即黑开票），将面临税务部门的处罚，包括但不限于补缴税款、罚款、甚至刑事责任。但这与甲方是否应履行纳税义务无关。

二. 甲方的纳税义务

1. 依法纳税是甲方的法定义务：根据税收法律法规，甲方作为纳税人，应就其取得的收入或发生的应税行为依法缴纳税款。支付工程款并不直接决定甲方是否需要纳税，而是甲方基于其经营行为或收入情况来确定的。
2. 不能因乙方行为而免除：甲方不能因为乙方存在黑开票等违法行为，就认为自己可以免除纳税义务。税务部门在征税时，会依据甲方的实际经营情况和收入来核定税额，而不会考虑乙方是否合规开票。

三. 总结与建议

• 甲方应依法纳税：无论乙方是否合规开票，甲方都应按照税收法律法规的要求，就其应税行为或收入依法缴纳税款。
• 注意合规风险：虽然甲方不能因乙方黑开票而免除纳税义务，但应与乙方保持合规的合作关系，要求乙方提供合法有效的发票，以避免自身卷入不必要的税务风险。

我建议甲方在支付工程款时，应要求乙方提供合规的发票，并确保自身的纳税行为符合税收法律法规的要求。如有进一步需要，您可以继续咨询我。