工程招标异议若涉及政府采购工程，则适用政府采购法。具体分析如下：

一. 工程招标异议的法律适用

• 法律依据：《中华人民共和国政府采购法》第四条明确规定，政府采购工程进行招标投标的，适用招标投标法。由此可推断，若工程招标异议涉及政府采购工程，其处理应遵循政府采购法的相关规定。

二. 政府采购工程的特点与招标方式

• 政府采购工程：根据《中华人民共和国政府采购法》的相关规定，政府采购工程是政府采购的一种形式，其采购过程需遵循公开透明、公平竞争、公正和诚实信用等原则。
• 招标方式：政府采购工程采用招标方式时，包括公开招标和邀请招标等，这些招标方式均受招标投标法的规范。

三. 异议处理与政府采购法的关联

• 异议处理：在工程招标过程中，若出现异议，需按照相关法律法规进行处理。若该工程属于政府采购工程，则异议的处理应受政府采购法的约束。
• 法律保障：政府采购法为政府采购工程的招标、投标、开标、评标、中标等各个环节提供了法律保障，包括异议的处理。

综上所述，若工程招标异议涉及政府采购工程，则适用政府采购法进行处理。这是因为政府采购工程进行招标投标的，明确适用招标投标法，而异议作为招标投标过程中的一部分，自然也受政府采购法的规范。如有进一步需要，您可以继续咨询我。