公司不能违法开除旷工员工，但可以按照法定程序处理旷工行为。针对您的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 公司处理旷工行为的法律依据

1. 规章制度的重要性：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，这些规章制度应当包括劳动纪律等内容，并且需要公示或告知劳动者。这意味着，公司有权在规章制度中明确旷工的定义、处理方式及后果。
2. 解除劳动合同的条件：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度时，用人单位可以解除劳动合同。因此，如果员工旷工行为严重违反了公司的规章制度，公司有权解除劳动合同。

二. 公司处理旷工行为的建议流程

1. 确认旷工事实：公司应首先确认员工是否存在旷工行为，并收集相关证据，如考勤记录、监控视频等。
2. 依据规章制度处理：根据公司的规章制度，对旷工员工进行相应的处理，如警告、罚款、解除劳动合同等。
3. 通知员工：公司应将处理决定通知员工，并说明处理的依据和理由。
4. 执行处理决定：如果员工对处理决定无异议，公司应执行处理决定；如果员工有异议，公司应按照法定程序进行协商或调解。

三. 员工旷工给公司造成损失的处理

1. 赔偿损失：根据《工资支付暂行规定（1994年版）》第十六条，如果员工旷工给公司造成了经济损失，公司有权要求员工赔偿。赔偿金额可从员工的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。
2. 法律途径追偿：如果员工拒绝赔偿或赔偿不足，公司可以通过法律途径追偿。

我建议公司在处理旷工行为时，应严格遵守法律法规和公司的规章制度，确保处理过程的合法性和公正性。同时，公司也应加强劳动纪律教育，预防旷工行为的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。