已证实虚开通知单不可以直接作为违法证据。以下是对此问题的详细分析：

一. 已证实虚开通知单的性质

• 已证实虚开通知单是异地税务机关之间发票协查的程序性文书，其性质属于税务机关的内部文书。根据《税收违法案件发票协查管理办法(试行)》的相关规定，它是税务机关在办理虚开案件中用于委托协查的材料。

二. 已证实虚开通知单的法律效力

• 不对行政相对人权利义务产生影响：生效的广西壮族自治区高级人民法院和福建省高级人民法院的行政裁定书均确认，已证实虚开通知单只是税务机关内部使用的文书，不对行政相对人的权利义务产生影响。
• 不能作为定罪证据：根据《刑事诉讼法》第五十四条第二款的规定，行政机关在行政执法和查办案件过程中收集的物证、书证、视听资料、电子数据等证据材料，在刑事诉讼中可以作为证据使用。但已证实虚开通知单并不属于这些法定的证据材料，因此不能作为定罪证据。

三. 已证实虚开通知单在司法实践中的应用

• 在司法实践中，虽然已证实虚开通知单有时会被办案机关视作认定涉案当事人虚开的证据之一，但其证明力存在争议。部分法院认为，仅凭已证实虚开通知单无法证明当事人构成虚开犯罪，还需要结合其他证据进行综合判断。
• 我的观点是，已证实虚开通知单只能作为税务机关立案检查的证据线索，不能独立完成证明涉案相关发票为虚开、涉案当事人构成虚开犯罪的证明责任。

四. 建议

• 在涉及虚开案件的司法实践中，应谨慎对待已证实虚开通知单的证据效力。办案机关应依法进行充分的调查取证，综合全案证据后才能作出发票是否虚开、当事人是否构成虚开犯罪的结论。
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