针对“非法经营个人犯罪员工如何处理”这一问题，首先我们要明确的是，员工在非法经营中的责任与处理方式需根据其具体行为、角色以及是否知情等因素来综合判断。以下是我对此问题的详细解答：

1. 员工是否知情与参与程度：

   • 若员工对非法经营活动并不知情，且未直接参与，那么其通常不会被视为犯罪，也就无需承担刑事责任。但可能需要根据公司内部规定或劳动合同承担相应的民事责任，如被解雇或受到其他纪律处分。
   • 若员工知情并参与了非法经营活动，那么其可能需要承担相应的法律责任。具体责任大小会根据其在非法经营中的角色、行为性质、造成的后果等因素来判定。

2. 法律责任的具体承担：

   • 刑事责任：对于直接参与非法经营且情节严重的员工，可能会面临刑事处罚，如罚款、有期徒刑等。这需要根据具体的法律规定和案件情况来判断。
   • 民事责任：员工可能需要因其参与非法经营而给公司或其他受害者造成的经济损失承担赔偿责任。这通常通过民事诉讼或仲裁程序来解决。
   • 行政责任：员工还可能因其违法行为而受到相关行政机关的行政处罚，如罚款、吊销执业资格等。

3. 员工应如何应对：

   • 若员工发现自己被卷入非法经营活动，应尽快向有关部门举报，并积极配合调查，以减轻自己的法律责任。
   • 员工应咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能面临的法律后果，以便做出正确的应对决策。

4. 公司层面的处理：

   • 公司应对非法经营活动进行彻底调查，查明事实真相，并依据公司规定和劳动合同对相关员工进行处理。
   • 公司应加强内部管理和合规建设，防止类似事件再次发生，并保护员工的合法权益。

综上所述，非法经营个人犯罪员工的处理是一个复杂的问题，需要根据具体情况来综合判断。如果你或你身边的人面临类似问题，建议尽快咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。