员工在知道工资多发后，应当主动与公司沟通并返还多发的工资。以下是对此问题的详细分析：

一. 员工应承担返还责任

1. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一百二十二条，因他人没有法律根据，取得不当利益，受损失的人有权请求其返还不当利益。同样，依据《中华人民共和国民法典》第九百八十五条，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。
2. 实际应用：在此情况下，员工因公司误操作多发了工资，这部分多发的工资即属于不当利益。员工在知情后，有义务返还这部分不当利益给公司，以避免公司遭受损失。

二. 员工应主动与公司沟通

1. 道德责任：虽然法律明确规定了返还责任，但员工在发现多发工资后，主动与公司沟通并说明情况，也是体现诚信和职业道德的表现。
2. 实际操作：员工可以与公司财务部门或人力资源部门联系，说明多发工资的情况，并协商返还方式。这样不仅可以避免不必要的误会和纠纷，还能维护良好的员工关系。

三. 特殊情况的考虑

1. 法律依据的例外：根据《中华人民共和国民法典》第九百八十五条的规定，存在某些特殊情况时，得利人可能不需要返还取得的利益。但这些特殊情况（如为履行道德义务进行的给付、债务到期之前的清偿、明知无给付义务而进行的债务清偿）在工资多发的场景中通常不适用。
2. 实际情况的考量：如果员工在发现多发工资后，已经合理使用了这部分资金，并且无法立即返还，可以与公司协商分期返还或采取其他合理的解决方案。

我建议，员工在发现工资多发后，应尽快与公司沟通并协商返还事宜。这样不仅能遵守法律法规，还能维护个人诚信和职业道德。如有进一步需要，您可以继续咨询我。